| 초록 |
정교한 대사 네트워크의 구축을 위해서는 대사산물, 대사회로, 유전정보 및 단백질-단백질 반응 등의 수많은 자료가 요구된다. 최근 genomics, proteomics, transcriptomics, metabolomics, fluxomics에서 생성된 다량의 omics data와 전산학적 도구의 개발로 미생물 전체의 종합적인 생화학적 대사네트워크를 구축할 수 있게 되었다. 이로 인해서, FBA (flux balance analysis) 을 이용하여 세포의 생리학적 현상을 컴퓨터상에서 모사할 수 있는 가상 미생물 모델(in silico microbe model)에 관한 연구가 활발히 진행되고 있다. 본 연구에서는 조절 요소들 (regulatory protein, genes, effectors etc.) 사이의 관계를 더욱더 직관적이고, 유연하게 표현하기 위해서 가중치(weight)와 정의된 기호로 계층적 조절 네트워크(hierarchical regulatory network)를 모델링하였고, 이를 FBA에 통합하였다. 이 모델링 방법을 기반으로 해서, 여러 가지 탄소원에서 성장하는 E. coli의 생리학적 거동을 모사하고, 이를 실험결과와 비교하였다. |
