| 초록 |
최근 완전히 서열화된 미생물 지놈들을 신속하고, 정확하게 전산적 분석을 실시하여, 세포 전체의 종합적인 생화학적 대사경로를 구축할 수 있게 되었다. 이로 인해서 세포의 기능을 PC상에서 모사할 수 있는 in silico models에 관한 연구가 활발히 진행되고 있다. In silico model 중에서, 생화학적 대사경로를 기반으로 한 FBA(flux balance analysis)는 대사 능력(metabolic capabilities), 세포 성장율, 대사 부산물, 원하는 성분을 생성시킬 수 있는 중요한 반응들을 정확하게 분석할 수 있다. 최근에 몇몇 연구자들은 logic equation으로 표현된 제약조건(regulatory constraints)을 Flux Balance Model에 통합 시키려고 시도하고 있다. 이 논리적 표현방법은 (I) binary system이기 때문에 복잡한 조절 단백질의 상호관계를 표현할 수 가 없는 문제가 발생될 수 있고, (II) 어떤 규칙들이 순서대로 적용되었는지 알 수 없기 때문에, 외부 환경 변화에 따른 유전자들의 조절 메커니즘을 알 수 가 없었다. 본 논문에서는 위에서 언급한 것들을 해결하기 위해서, (I) 조절 요소들 (regulatory protein, genes, effectors etc.)사이의 관계를 더욱더 유연하게 표현하기 위해서 결합의 정도를 나타내는 가중치 개념을 도입하였고, (II) 외부환경 변화에 따른 유전자들의 조절 메커니즘을 표현하기 위해서, 정의된 기호로 계층적 조절 네트워크(hierarchical regulatory network)를 모델링하였다. |
